南投的交通較其它縣市較為不便，為臺灣唯一一個不靠海的縣。鐵路運輸方面，自彰化二水到水里、車埕的集集支線鐵路橫貫南投縣中部，并連接縣內各主要公路。基隆、臺北、臺中、高雄等地皆有臺汽客運開往南投。彰化、員林客運亦有公車連接了草屯、埔里、竹山、集集、水里等各大重要鄉鎮，或由臺中干城站搭聯營公車也可分抵南投各地。南投境內大眾運輸以彰化、員林、南投客運為主，草屯、南投市、埔里、竹山、水里為五大轉運站。草屯有多家客運可抵國姓、埔里，埔里則有南投客運發往廬山、霧社、清境農場一線，竹山是往鹿谷、溪頭、杉林溪的大本營，水里除有員林客運行駛新中橫沿線外，還有南投、豐榮客運北往日月潭、埔里，南向地利山區，形成緊密的聯絡網。
南投交通——航空
南投縣沒有飛機場，可乘飛機至桃園國際機場（或高雄國際機場），然后搭乘桃園客運前往南投；也可由中壢市、桃園市轉乘鐵路抵達。
南投交通——鐵路
西部縱貫線雖未經過南投縣，但自彰化二水到水里、車埕的集集支線鐵路，卻橫貫南投縣中部，并連接縣內各主要公路，是條便捷的交通線。
南投交通——公路
基隆、臺北、臺中、高雄等地皆有臺汽客運開往南投；而彰化縣內的彰化、員林客運亦有公車可聯絡草屯、埔里、竹山等。
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